A implementação teve início com grupos de crianças entre os 3 e os 6 anos, de dois estabelecimentos de educação pré-escolar da cidade de Coimbra, através de um projeto-piloto (fase 1):
No 2º semestre do ano letivo 2015-16 integraram os Programas Casa da Mata 2 grupos constituídos por 8 crianças cada, de 5 anos de idade, do Jardim de Infância dos Serviços Sociais da Universidade de Coimbra e do Jardim de Infância do Areeiro do Agrupamento de Escolas Coimbra Sul.
No 1º semestre do ano letivo 2016-17 integraram dois grupos de 12 crianças cada, de 4/5 anos de idade, do Jardim de Infância dos Serviços Sociais da Universidade de Coimbra concluindo-se assim a fase piloto do Projeto.
No 2.º semestre do ano eltivo 2017-17 integraram outros dois grupos de 18 crianças, do Jardim de Infância dos Serviços Sociais da Universidade de Coimbra.
Iniciando-se a fase de expansão do Projeto, no ano letivo 2017-18, os Programas Casa da Mata desenvolveram-se com quatro grupos de 24 crianças, dos Jardins de Infância Creche e Jardim de Infância Mondego – Associação de Intervenção Social; Centro de Bem Estar Social da Sagrada Família; Serviços Sociais da Universidade de Coimbra, e Jardins de Infância do Areeiro e Quinta das Flores, do Agrupamento de Escolas Coimbra Sul.
No ano letivo 2018-19, os quatro grupos de crianças foram formados com o Jardim de Infância dos Serviços Sociais da Universidade de Coimbra, Creche e Jardim de Infância Mondego – Associação de Intervenção Social, Jardim-de-Infância Providência Portuguesa, Jardim de Infância da Quinta das Flores, do Agrupamento de Escolas Coimbra Sul, e Jardim de Infância dos Olivais, do Agrupamento de Escolas Martim de Freitas.
Este ano letivo, os Programas Casa da Mata começaram com a participação do Jardim-de-Infância Previdência Portuguesa e Creche e Jardim de Infância Mondego – Associação de Intervenção Social, com o grupo Os Girinos.